医学基础实验教学中心（简称实验教学中心）成立于2002年，2013年被评为浙江省实验教学示范中心，是培养高素质、创新型实用医学人才的重要基地。
实验教学中心实行主任负责制，下设形态实验、机能实验和测试分析三大平台，包括人体解剖学、组织胚胎学、病理学、生理学、病理生理学、生物化学与分子生物学、病原生物与免疫学、细胞生物学共8个教学实验室。以“基础技能实验－综合性实验－设计、创新性实验”为框架，以优质资源融合为依托，创建了跨学科、与临床相联系的实验内容新体系。
中心拥有一支兼具教研热情和学术底蕴的实验教师队伍，每年承担基础医学、临床医学、口腔医学、预防医学、护理学、药学等多个专业本科生及基础医学院研究生的实验教学任务，中心年均承担实验教学约12000学时。同时指导大学生开展“科创”研究和以研究为基础的学习（RBL）。
中心坚持以学生为本、以教学为中心的理念，在中心管理运行体制和实验教学改革进行了积极稳妥和富有成效的探索，逐渐形成了一套独具特色的实验教学新体系和培养人才新模式。实验教学改革不断深入，形成了以人为本，因材施教，基础与临床密切结合，教学与科研相互促进，课内课外有机互补，分层次，立体化的培养医学人才的实验教学培养新模式。
