教育和工作经历
2000年09月-2004年07月 兰州大学生命科学学院,生物学,理学学士
2004年09月-2008年07月 清华大学生物科学与技术系&医学院,生物学,理学博士
2008年07月-2008年12月 清华大学蛋白质科学教育部重点实验室,研究助理
2009年01月-2013年01月 美国Scripps研究所,美国圣迭戈,Research Associate
2013年02月至今 杭州师范大学基础医学院,教授,博士生导师
联系方式
杭州师范大学基础医学院
E-mail:xuxl@hznu.edu.cn
研究经历
教授,课题组长 (杭州师范大学基础医学院)
以冷冻电镜和X-射线晶体学为主要手段,综合运用各种生物化学、生物物理和细胞生物学方法,研究:
(1)细菌的光合作用和能量代谢机制,及其在绿色氢能和生物固碳中的应用;
(2)基于结构的蛋白质分子设计,及其在医药中间体合成中的应用;
(3)血管生成抑制剂类微生物药物的研发。
Research Associate (美国Scripps研究所)
(1)系统揭示了丝氨酰-tRNA合成酶调控脊椎动物血管发育的机理;
(2)阐明了色氨酰-tRNA合成酶抑制肿瘤新血管生成的分子机制。
博士 (清华大学) ,从事冠状病毒复制转录机制研究:
(1)解析了多个冠状病毒蛋白质的晶体结构和分子功能;
(2)针对冠状病毒非结构蛋白的抑制剂筛选和抗病毒药物设计。
人才计划和奖励
2021年 浙江省“万人计划”青年拔尖人才
2021年 杭州市教育局系统优秀教师
2019年 浙江省“院士结对培养青年英才”
2019年 “新型稀缺酶资源研发体系创建及其在医药领域应用”国家科技进步二等奖(10/10)
2017年 杭州市“131”中青年人才培养计划 第一层次
2013年 杭州市首届“西湖学者”(杭州市教育局)
主持科研项目
1. 国家自然科学基金面上项目:替代复合体III在光合和呼吸电子传递链中的作用机制 ,2022-2025年;
2. 国家自然科学基金面上项目:光合玫瑰菌三羟基丙酸循环固碳途径的分子机制,2019-2022年;
3. 国家自然科学基金面上项目:光合玫瑰菌核心光合复合体的结构与功能研究,2016-2019年;
4. 国家自然科学基金青年项目:色氨酰tRNA合成酶抑制新血管生成的分子机制2015-2017年;
5. 浙江省自然科学基金杰出青年项目:光合玫瑰菌的电子传递调控与产氢2022-2025年;
6. 浙江省自然科学基金项目:色氨酰tRNA合成酶抑制肿瘤新血管生成的分子机制研究,2014-2017年;
7.“杭州市创新药物研究” 重中之重实验室项目,方向负责人,2014-2017年;
8. 横向课题:4个检测抗原诊断用单抗或相关分子酶工具的研发2017-2019;
9. 杭州师范大学科研培育项目:光合玫瑰菌吸收、传递和转化光能的分子机制,2019-2023年。
学术兼职
1.“衰老与癌变生物学”浙江省重点实验室副主任(2019年起)
2. 浙江省生物物理学会副理事长(2018年04月-2022年04月)
代表性论著(* corresponding author)
[1] Shi Y#, Xin Y#, Wang C#, Blankenship RE, Sun F*, Xu X*. Cryo-EM structures of the air-oxidized and dithionite-reduced photosynthetic alternative complex III from Roseiflexus castenholzii. Science Advances. 2020, 6(31):eaba2739.
[2] Wang C#, Xin Y#, Min Z, Qi J, Zhang C, Xu X*. Structural basis underlying the electron transfer features of a blue copper protein auracyanin from the photosynthetic bacterium Roseiflexus castenholzii. Photosynth Res. 2020, 143(3), 301-314.
[3] Zhang C#, Min Z#, Liu X#, Wang C#, Wang Z, Shen J, Tang W, Zhang X, Liu D, Xu X*. Tolrestat acts atypically as a competitive inhibitor of the thermostable aldo-keto reductase Tm1743 from Thermotoga maritima. FEBS Lett. 2019, 594(3):564-580.
[4] Xin Y#, Shi Y#, Niu T#, Wang Q, Niu W, Huang X, Ding W, Yang L, Blankenship RE, Xu X*, Sun F*. Cryo-EM structure of the RC-LH core complex from an early branching photosynthetic prokaryote. Nat Commun. 2018, 9(1):1568.
[5] Xu X*, Zhou H, Zhou Q, Hong F, Vo MN, Niu W, Wang Z, Xiong X, Nakamura K, Wakasugi K, Schimmel P, Yang XL*. An alternative conformation of human TrpRS suggests a role of zinc in activating non-enzymatic function. RNA Biol. 2018, 15(4-5):649-658.
[6] Wang F, Chen C, Liu X, Yang K, Xu X*, Yang H*. Crystal structure of feline infectious peritonitis virus main protease in complex with synergetic dual inhibitors. J Virol. 2015, 90(4):1910-7.
[7] Zhu L, Xu X, Wang L, Dong H, Yu B*, Ma Y*. NADP+-Preferring d-Lactate Dehydrogenase from Sporolactobacillus inulinus. Appl Environ Microbiol. 2015, 81(18):6294-301.
[8] Shi Y, Xu X, Zhang Q, Fu G.S., Mo Z.Y., Wang George S, Kishi S, Yang X.L*. tRNA synthetase counteracts c-Myc to develop functional vasculature. eLife. 2014, 3: e02349.
[9] Xu X, Shi Y, Yang X.L*. Crystal structure of human seryl-tRNA synthetase and Ser-SA complex reveals a molecular lever specific to higher eukaryotes. Structure. 2013, 21(11): 2078-86.
[10] Xu X#, Shi Y#, Zhang HM, Swindell EC, Marshall AG, Guo M, Kishi S,Yang XL*. Unique domain appended to vertebrate tRNA synthetase is essential for vascular development. Nat Commun. 2012, 3: 681.
[11] Zhou Q, Kapoor M, Guo M, Belani R, Xu X, Kiosses WB, Hanan M, Park C, Armour E, Do MH, Nangle LA, Schimmel P, Yang XL*. Orthogonal use of a human tRNA synthetase active site to achieve multifunctionality. Nat Struct Mol Biol. 2010, 17(1): 57-61.
[12] Xu X, Zhai Y, Sun F, Lou Z, Su D, Xu Y, Zhang R, Joachimiak A, Zhang XC, Bartlam M & Rao Z*. New antiviral target revealed by the hexameric structure of mouse hepatitis virus nonstructural protein nsp15. J Virol. 2006, 80(16): 7909-7917.
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