教育和工作经历

2000年09月-2004年07月 兰州大学生命科学学院，生物学，理学学士

2004年09月-2008年07月 清华大学生物科学与技术系&医学院，生物学，理学博士

2008年07月-2008年12月 清华大学蛋白质科学教育部重点实验室，研究助理

2009年01月-2013年01月 美国Scripps研究所，美国圣迭戈，Research Associate

2013年02月至今  杭州师范大学基础医学院，教授，博士生导师

联系方式

杭州师范大学基础医学院

E-mail：xuxl@hznu.edu.cn

研究经历

教授，课题组长 (杭州师范大学基础医学院)

以冷冻电镜和X-射线晶体学为主要手段，综合运用各种生物化学、生物物理和细胞生物学方法，研究：

（1）细菌的光合作用和能量代谢机制，及其在绿色氢能和生物固碳中的应用；

（2）基于结构的蛋白质分子设计，及其在医药中间体合成中的应用；

（3）血管生成抑制剂类微生物药物的研发。

Research Associate (美国Scripps研究所)

（1）系统揭示了丝氨酰-tRNA合成酶调控脊椎动物血管发育的机理；

（2）阐明了色氨酰-tRNA合成酶抑制肿瘤新血管生成的分子机制。

博士 (清华大学) ，从事冠状病毒复制转录机制研究：

（1）解析了多个冠状病毒蛋白质的晶体结构和分子功能；

（2）针对冠状病毒非结构蛋白的抑制剂筛选和抗病毒药物设计。

人才计划和奖励

2023年  浙江省“三育人”岗位建功活动先进个人

2021年  浙江省“万人计划”青年拔尖人才

2021年  杭州市教育局系统优秀教师

2019年  浙江省“院士结对培养青年英才”

2019年 “新型稀缺酶资源研发体系创建及其在医药领域应用”国家科技进步二等奖（10/10）

2017年   杭州市“131”中青年人才培养计划 第一层次

2013年   杭州市首届“西湖学者”（杭州市教育局）

主持科研项目

1.国家自然科学基金面上项目：光合玫瑰菌ATP合酶的结构和作用机制，2025-2028年；

2. 国家自然科学基金国际(地区)合作与交流项目：探索早期原核光合生物光系统的膜组织和电子传递机制，2025-2026年；

3. 浙江省自然科学基金杰出青年延续项目：光合玫瑰菌天然光合膜的结构和光合电子传递链的体外组装，2026-2028；

4. 国家自然科学基金面上项目：替代复合体III在光合和呼吸电子传递链中的作用机制 (32171227)，2022-2025年；

5. 国家自然科学基金面上项目：光合玫瑰菌三羟基丙酸循环固碳途径的分子机制 (31870740)，2019-2022年；

6. 国家自然科学基金面上项目：光合玫瑰菌核心光合复合体的结构与功能研究(31570738)，2016-2019年；

7. 国家自然科学基金青年项目：色氨酰tRNA合成酶抑制新血管生成的分子机制(31400630)，2015-2017年；

8. 浙江省自然科学基金杰出青年项目：光合玫瑰菌的电子传递调控与产氢 (LR22C020002)，2022-2024年；

9. 浙江省自然科学基金一般项目：色氨酰tRNA合成酶抑制肿瘤新血管生成的分子机制研究(LY14C050002)，2014-2017年。

学术兼职

1.“衰老与癌变生物学”浙江省重点实验室副主任（2019年起）  

2.  浙江省生物物理学会副理事长（2018年04月-2022年04月）

代表性论著(* corresponding author)

[1] Zhang X, Wu J, Min Z, Wang J, Hong X, Pei1 X, Rao Z, Xu X*. Structure of ATP synthase from an early photosynthetic bacterium Chloroflexus aurantiacus. PNAS. 2025, 122(13): 2425824122.

[2] Zhang X^#, Wu J^#, Wang J, He H, Liu A, Hong X, Yu Y, Pei X, Xin Y^*, Yu L^*, Tian C^*, Xu X*. Structural basis of menaquinone reduction by succinate dehydrogenase from Chloroflexus aurantiacus. Nature Communications. 2025, 16:10782.

[3] Wu W, Fang H, He H, Wu J, Gong Z, Li C, Pei X, Xu X*. Crystal structure of the alternative complex III from the phototrophic bacterium Chloroflexus aurantiacus. Structure. 2025, 33: 29-38

[4] Shen J^#, Wu W^#, Wang K, Wu J, Liu B, Li C, Gong Z, Hong X, Fang H, Xu X*. Chloroflexus aurantiacus acetyl-CoA carboxylase evolves fused biotin carboxylase and biotin carboxyl carrier protein to complete carboxylation activity. mBio. 2024, 15(5): e0341423.

[5] Shen J, Wu W, Wang K, Wu J, Liu B, Li C, Gong Z, Hong X, Fang H, Zhang X, Xu X*.Chloroflexus aurantiacus acetyl-CoA carboxylase evolves fused biotin carboxylase and biotin carboxyl carrier protein to complete carboxylation activity. mBio. 2024 ,15(5):e0341423.

[6] Xin J^#, Shi Y^#, Zhang X^#, Yuan X, Xin Y, He H, Shen J, Blankenship RE, Xu X*. Carotenoid assembly regulates quinone diffusion and the Roseiflexus castenholzii reaction center-light harvesting complex architecture. Elife. 2023, 12: e88951.

[7] Zhang X^#, Xin J^#, Wang Z^#, Wu W, Liu Y, Min Z, Xin Y, Liu B, He J, Zhang X, Xu X*. Structural basis of a bi-functional malonyl-CoA reductase (MCR) from the photosynthetic green non-sulfur bacterium Roseiflexus castenholzii. mBio. 2023, 14(4): e0323322.

[8] Luo H, Jiao Q, Shen C, Gong W, Yuan J, Liu Y, Chen Z, Liu J, Xu X, Cong Y*, Zhang X*. UFMylation of HRD1 regulates Endoplasmic Reticulum Homeostasis. The FASEB Journal. 2023,37(11): e23221.

[9] Gong W, Jiao Q, Yuan J, Luo H, Liu Y, Zhang Y, Chen Z, Xu X, Bai L*, Zhang X*. Cardioprotective and anti-inflammatory effects of Caveolin 1 in experimental diabetic cardiomyopathy. Clin Sci (Lond). 2023, 137(6):511-525.
[10] Du J, Xin J, Liu M, Zhang X, He H, Wu J, Xu X*. Preparation of photo-Bioelectrochemical cells with the RC-LH complex from Roseiflexus castenholzii. Front. Microbiol. 2022, 13: 928046.

[11] Shi Y^#, Xin Y^#, Wang C^#, Blankenship RE, Sun F*, Xu X*. Cryo-EM structures of the air-oxidized and dithionite-reduced photosynthetic alternative complex III from Roseiflexus castenholzii. Science Advances. 2020, 6(31):eaba2739.

[12] Wang C^#, Xin Y^#, Min Z, Qi J, Zhang C, Xu X*. Structural basis underlying the electron transfer features of a blue copper protein auracyanin from the photosynthetic bacterium Roseiflexus castenholzii. Photosynth Res. 2020, 143(3), 301-314.

[13] Xin Y, Shi Y, Niu T, Wang Q, Niu W, Huang X, Ding W, Yang L, Blankenship RE, Xu X*, Sun F*. Cryo-EM structure of the RC-LH core complex from an early branching photosynthetic prokaryote. Nature Communications. 2018, 9(1):1568.

[14] Xu X*, Zhou H, Zhou Q, Hong F, Vo MN, Niu W, Wang Z, Xiong X, Nakamura K, Wakasugi K, Schimmel P, Yang XL*. An alternative conformation of human TrpRS suggests a role of zinc in activating non-enzymatic function. RNA Biology. 2018;15(4-5):649-658.

[15] Xu X, Zhou H, Zhou Q, Hong F, Vo MN, Niu W, Wang Z, Xiong X, Nakamura K, Wakasugi K, Schimmel P, Yang XL*. An alternative conformation of human TrpRS suggests a role of zinc in activating non-enzymatic function. RNA Biol. 2018, 15(4-5):649-658.

[16] Xu X, Shi Y, Zhang HM, Swindell EC, Marshall AG, Guo M, Kishi S,Yang XL*. Unique domain appended to vertebrate tRNA synthetase is essential for vascular development. Nature Communications. 2012, 3: 681.